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SureDesign 是一個基于網(wǎng)頁的應(yīng)用程序,利用 SurePrint 寡核苷酸制造技術(shù)的靈活性,創(chuàng)建定制的 NGS 靶向序列捕獲文庫、CGH 微陣列設(shè)計和 FISH 探針。|SureDesign 對所有注冊用戶免費,具有直觀的設(shè)計向?qū)?,可以針對特定研究需求?chuàng)建定制基因組合,以及利用多個應(yīng)用程序進(jìn)行交叉驗證。|要創(chuàng)建定制設(shè)計,請訪問下方"工具"部分中的 SureDesign 門戶網(wǎng)站。
Alissa Interpret 研究是基于網(wǎng)頁的信息學(xué)解決方案,可使臨床研究實驗室高效地分類、優(yōu)化和報告基因組變異。該解決方案能夠?qū)崿F(xiàn) NGS 和 CGH 微陣列芯片工作流程(從變異篩選、標(biāo)注到優(yōu)化和分級,再到起草實驗室報告)的自動化。|我們基于網(wǎng)頁的解決方案專為臨床研究實驗室而設(shè)計,提供了訪問豐富標(biāo)注來源和數(shù)據(jù)庫的途徑。它支持建立定制優(yōu)化變異數(shù)據(jù)庫,并為變異評估提供各種深入的分析工具。
安捷倫特征提取軟件可自動讀取和處理多達(dá) 100 個原始微陣列芯片圖像文件。該軟件可查找并放置微陣列芯片網(wǎng)格,剔除離群像素,準(zhǔn)確確定特征強度和比率,標(biāo)記離群像素,并計算統(tǒng)計置信度。
Alissa Align & Call 是 Alissa 臨床信息學(xué)平臺上可擴(kuò)展的 NGS 數(shù)據(jù)分析模塊,用于分析原始測序數(shù)據(jù)。它與用于臨床級變異評估和報告的 Alissa Interpret* 無縫集成,降低了從原始數(shù)據(jù)到報告起草的工作流程的復(fù)雜性并縮短了用時。|Align & Call 的高質(zhì)量測序讀出使用針對 Agilent SureSelect、HaloPlex 和 OneSeq 靶向序列捕獲文庫和試劑優(yōu)化的專有算法,實現(xiàn)與識別出的變異的有效比對,便于進(jìn)行檢測、標(biāo)注和可視化。|*Alissa Interpret 與所有生成標(biāo)準(zhǔn) VCF 文件的二級數(shù)據(jù)分析工具均兼容。
Agilent CytoGenomics 軟件為細(xì)胞遺傳學(xué)家提供了先進(jìn)的數(shù)據(jù)分析工具。該系統(tǒng)具有從數(shù)據(jù)上傳到最終報告的簡化工作流程,能夠處理體質(zhì)性和血癌樣品的 CGH 和 CGH+SNP 數(shù)據(jù)。|該多分析軟件專為細(xì)胞遺傳學(xué)研究而設(shè)計,以便從生物學(xué)角度對所記錄的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。直觀的細(xì)胞遺傳學(xué)分析工作流程可以準(zhǔn)確檢測拷貝數(shù)變化和拷貝數(shù)中性變異(包括 LOH 和 UPD),并以一系列方便的格式輸出結(jié)果。
自 2023 年 12 月 31 日起,安捷倫已停止為 SureCall 發(fā)放新許可證,所有許可證將于 2024 年 6 月 30 日或此日期之前停用。|SureCall 是一款用于研究的桌面應(yīng)用程序,結(jié)合了新穎和廣泛接受的開源算法,用于從比對到突變分類和標(biāo)注的端到端 NGS 數(shù)據(jù)分析,支持安捷倫靶向序列捕獲應(yīng)用。 |SureCall 提供了四種分析類型:單個、成對、家系和 OneSeq CNV 與突變分析。SNPPET SNP 識別工具是一種最適合檢測低頻變異的安捷倫算法,具有高靈敏度和特異性。
Agilent eArray 為微陣列芯片設(shè)計和寡核苷酸文庫提供了高級數(shù)據(jù)分析軟件。分析人員通過該系統(tǒng),利用 Agilent SurePrint 寡核苷酸制造技術(shù)的靈活性創(chuàng)建定制微陣列芯片。有多種不同的微陣列芯片格式可供選擇。|該系統(tǒng)使分析人員能夠快速輕松使用基于網(wǎng)頁的應(yīng)用技術(shù)創(chuàng)建分析。可以為基因表達(dá)、microRNA、模式生物以及寡核苷酸文庫合成 (OLS) 和突變形成開發(fā)微陣列芯片設(shè)計和文庫。該系統(tǒng)還增強了協(xié)作,使分析人員能夠通過共享和發(fā)布定制設(shè)計更好地實現(xiàn)在線協(xié)作。
Agilent GeneSpring 是一款功能強大、操作方便的統(tǒng)計學(xué)工具,可實現(xiàn)直觀的數(shù)據(jù)分析和可視化。GeneSpring 專門針對生物學(xué)家的需求而設(shè)計,具有交互式環(huán)境,可從生物學(xué)角度促進(jìn)對轉(zhuǎn)錄組學(xué)、基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和 NGS 數(shù)據(jù)的研究和理解。|GeneSpring 使您可以快速、可靠地鑒定具有統(tǒng)計學(xué)和生物學(xué)意義的靶標(biāo)。
安捷倫基因組學(xué) NextGen 工具包 (AGeNT) 是基于 Java 的軟件模塊,專門處理 Agilent SureSelect 和 HaloPlex 文庫測序后生成的靶向高通量測序數(shù)據(jù)的讀出序列。 |使用 AGENT 模塊的 Trimmer 實用程序處理讀出序列,識別和去除接頭序列并提取雙分子條形碼(適用于 SureSelect XT HS2 和 SureSelect MAX)。|使用 AGeNT 模塊的 LocatIT(適用于 SureSelect QXT、XT LI 和 Haloplex HS)和 CReaK(適用于 SureSelect XT HS、XT HS 2 和 MAX)實用程序處理來自 SureSelect Illumina 測序運行的分子條形碼 (MBC) 信息,并選擇對重復(fù) read 進(jìn)行標(biāo)記或合并,然后輸出為 BAM 文件格式。
僅供科研使用。不用于臨床診斷用途。不用于商業(yè)用途。
僅供科研使用。不用于臨床診斷用途。不用于商業(yè)用途。
安捷倫基因組工作臺 (AGW) 軟件可為關(guān)鍵微陣列芯片應(yīng)用提供強大的分析功能,包括人和模式生物的 CGH、CGH+SNP、ChIP-on-Chip 及 DNA 甲基化。利用 AGW,科學(xué)家們可以更改過濾器、閾值和其他設(shè)置,以優(yōu)化實時可視化效果。 |在單個系統(tǒng)中分析多個 DNA 微陣列芯片數(shù)據(jù)有助于簡化基因組工作流程。此外,該系統(tǒng)還具有輕松更改分析設(shè)置、測試不同過濾器和閾值以及實時可視化效果的功能。
安捷倫 SLIMS 是一款實驗室管理解決方案,可幫助您簡化和組織實驗室運營。它具有一系列功能,包括樣品追溯、實驗管理和自動化結(jié)果報告。安捷倫 SLIMS 憑借直觀的界面和靈活的選項,可根據(jù)滿足您實驗室的特定需求量身定制,適用于任何規(guī)?;驈?fù)雜程度。除提高效率和準(zhǔn)確度以外,該軟件還可以快速、輕松地部署,在安裝過程中為您節(jié)省時間和精力。